Флинн ушел в отставку в феврале на фоне обвинений в том, что не раскрыл полностью содержание своих разговоров с российским послом в Вашингтоне Сергеем Кисляком. СМИ утверждали со ссылкой на спецслужбы, что Флинн обсуждал с Кисляком возможное снятие санкций США против России. Флинн это отрицал. В Кремле заявили, что разговор Флинна и Кисляка имел место, но его содержание передали неверно.
В пятницу Флинну официально были предъявлены обвинения в даче ложных показаний ФБР по поводу его встреч с российскими официальными лицами. Он признал вину и договорился о сотрудничестве с властями.
Как следует из материалов соглашения адвокатов Флинна со следствием, которые распространили американские СМИ, обвиняемый обязуется "целиком и полностью, честно и откровенно" сотрудничать со всеми правоохранительными органами. Такое сотрудничество "может включать, но не может быть ограничено ответами на вопросы, письменными показаниями под присягой, прохождением проверки на детекторе лжи под контролем правительства и участием в операциях под прикрытием, которые проводят правоохранительные органы".
При этом отказ от какой-либо процедуры будет считаться нарушением соглашения со следствием, что, с одной стороны, освободит следствие от взятых им обязательств по этому соглашению, но, с другой стороны, не снимет обязательств с Флинна и не отменит его признания вины.